长城军工依照《公司法》《证券法》《上市公司治理准则》，并参照《上市公司章程指引》等指引性文件，建立健全了股东大会、董事会、监事会和管理层，并在董事会下设了战略委员会、审计委员会、薪酬与考核委员会、提名委员会四个专门委员会；主要职能部门包括即办公室、科技质量数字化部、证券部、人力资源部、财务部、党群工作部、审计风控部、经济运行部、安全管理部、军品发展部、保密办公室。